【196年】
刘馥说服袁术的将领戚寄、秦翊,带着部队一起去投奔曹操。曹操非常高兴,任命他为司徒府掾。
【199年】
孙策所置庐江太守李述攻杀扬州刺史严象,庐江梅乾、雷绪、陈兰等聚众数万在江、淮间,郡县残破。曹操刚与袁绍关系恶化,认为刘馥可以负责东南的事务,于是上表任刘馥为扬州刺史。刘馥受命后,单马来到合淝空城,建立州治,南面安抚雷绪等人,使他们安心驻扎,缴纳贡赋。刘馥在几年中广泛施行恩惠与教化,百姓非常满意他的治理,流民跨山过河来归顺的有几万人。刘馥又汇聚读书人,设立学校,大规模屯田,兴修治理芍陂、茹陂、七门、吴塘等堤堰陂塘灌溉稻田,使官府和百姓都有了粮食储备。刘馥又修建城墙,堆积木石,编作草苫数千万枚,储存鱼膏数千斛,准备做战时防守用。
【208年】
刘馥去世。后来,孙权率兵十万围攻合淝城百余日,时天连雨,城欲崩,于是用苫蓑覆盖城墙,又在晚上燃鱼膏照亮城外,观察敌人的举动来作防备,于是敌人败走。经过此战,扬州的军民更加追念他,认为古时董安守晋阳的功劳也比不过他,而所修陂塘的好处,后世仍在受用。刘馥的儿子刘靖,在魏官至镇北将军。